2017-AFNI培训班通知(第二轮)

2017年12月4-9日 深圳大学

广东省认知科学学会/深圳大学心理与社会学院

 

2017-AFNI培训班通知(第二轮)

广东省认知科学学会/深圳大学心理与社会学院

 

磁共振脑成像是神经科学研究的重要手段。随着大数据时代的到来,磁共振脑成像数据分析被应用于越来越多的研究当中。AFNI (Analysis of Functional Neuro Images)是美国国立健康研究院(National Institute of Health, NIH)科学与统计计算中心(Scientific and Statistical Computing Core, SSCC)开发的一个功能强大的磁共振脑成像数据分析软件。在磁共振脑成像研究领域,AFNI以其独特的使用灵活性和高效专业的支持团队著称,在全世界范围内拥有广泛的用户群。

为推动和提升磁共振脑成像研究,促进领域内同行之间的交流,广东省认知科学学会以及深圳大学心理与社会学院特邀AFNI软件的开发领导者Robert Cox教授带领NIH SSCC开发团队中的Gang Chen博士和Paul Taylor博士赴深圳大学,在2017年12月4日至12月9日举办为期一周的AFNI使用培训班。

本次培训班面向心理学、认知神经科学、生物医学工程学,临床医学等领域的科研人员和研究生,及希望在该领域进行深造的高年级本科生。除了在前5天的课程中和AFNI开发团队直接沟通之外。本届培训班还在12月9日留出最后一整天的空余时间给学员,针对他们自己科研中的特定问题与AFNI团队的专家进行较为具体和深入的交流。本届学习班诚挚欢迎您的参加,期盼在寒冷的冬天于温暖的深圳与您相聚!

一、时间:2017年12月4日—— 9日(3日报到,4至8日上课,9日自由交流)

二、地点:深圳大学南校区,医学院附楼L4-201(下图红色标记处,现场会有标识引导)

三、授课教师 (https://afni.nimh.nih.gov/Staff)

Robert W. Cox

              AFNI主要创始人,现为美国国家精神卫生院(NIMH)科学运算与统计小组主任

Gang Chen

              2003年加入AFNI小组,主要负责开发AFNI的高级的统计分析工具

Paul Taylor

              AFNI开发团队成员,主要负责皮层表面分析以及弥散张量成像分析工具的开发

四、授课内容:

Using the AFNI graphical user interface (GUI) to examine 3D and 3D+time datasets;

An overview of the brain atlas datasets incorporated into the AFNI GUI;

Setting up individual subject time series analyses using processing scripts and GUI;

Interactive viewing and thresholding of functional activation maps;

Group (inter-subject) data analysis, ranging from simple to complex statistical methods;

Resting state FMRI analyses: interactive explorations and batch computations;

Task-based connectivity analyses;

Surface-based display and data analysis with SUMA;

Tools for DTI analysis in AFNI

Recent updates on false positive control

Real-time scanner-to-AFNI data acquisition, display, and processing.

 

五、学员要求

学员对象为心理学、医学、生物学、计算机、教育学等领域的教研人员、研究生或高年级本科生。为保证学习质量,培训班参加人员总数限制为50名。学员完成学习,初步掌握AFNI技术后发给结业证。

参加培训的人员需自带笔记本电脑并提前安装好AFNI软件及示例数据,具体说明可查阅:

https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/htmldoc/background_install/bootcamp_stuff.html

 

这里有不同操作系统的安装操作指示以及培训班上课的演示数据:

https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/htmldoc/background_install/install_instructs/index.html

 

对于已经装好AFNI可执行程序(binaries)的学员,可用如下命令把软件升级到最新版本:

@update.afni.binaries -d

 

安装/升级完成之后,可用如下命令对软件系统的完整性进行检查:

afni_system_check.py -check_all

 

对于使用Mac操作系统的学员,安装netpbm有时候也有用处:

http://macappstore.org/netpbm/

 

对Unix系统不熟悉的学员需要先从这里熟悉:

https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/htmldoc/background_install/unix_tutorial/index.html

 

有问题可以在AFNI开发小组的论坛(AFNI message board)上提出:

https://afni.nimh.nih.gov/afni/community/board/list.php?1

 

六、学费和报名方式:

  1. 学费

普通学员:人民币4000元/人;在读博士/硕士3200元/人(凭学生证)。费用包括培训费、材料费,以及5天餐券。交通及住宿费用自理。

通过填写会议回执(附件),发送email到brainsci@szu.edu.cn完成会议注册。

  1. 汇款账户信息【请务必在汇款附言处注明:姓名、单位和会议费】

收款单位:广东省认知科学学会

银行账号:7441710183100000280

开户银行:中信银行深圳南山支行

报名以缴费成功为准,需要刷公务卡可以现场缴费,因名额有限,额满截止。

七、交通及住宿:

1.机场到达:

最快:机场地铁站D口 乘坐地铁11号线福田方向,到前海湾换乘1号线罗湖方向至大站后乘坐B728路至南区运动广场,下车后可步行去会场

巴士:机场新航站楼 公交站 乘坐机场8线 到科苑立交南,换乘M209至南区运动广场,下车后可步行去会场

2.火车到达:乘坐B682直达南区运动广场,后步行前往会场

3.高铁到达:

最快:深圳北站地铁口B口,乘坐4号线往福田方向至会展中心,转1号线往机场东方向至世界之窗,后再转2号线往赤湾方向至科苑站,后步行到达会场

巴士:深圳北公交站乘坐81路到科苑北,换乘M209到达南区运动场,后步行去会场

4.乘船到达:蛇口港地铁站乘坐2号线直达科苑,后步行前往会场

提示:在公交站深圳大学站、深大北门站下车的学员还需进入校内乘坐校园小巴或直接乘坐环校巴B728(1元/人)在南区运动广场下车,进入南校区步行至理工教学楼。

5.周边酒店(按照距离会场由近及远排序)推荐:深圳天天惠公寓酒店(266起);百姓家经济酒店(158起);枫叶品园公寓(232起);新年酒店(368起)。

 

八、联系人

程老师:0755-26421385/13534127995;chengjp@szu.edu.cn

会议邮箱:brainsci@szu.edu.cn

深圳市南山区南海大道3688号师院B412

会议网址http://www.cognscigd.cn

 

广东省认知科学学会

深圳大学心理与社会学院

二○一七年九月六日

 

附件下载2017-AFNI培训班报名表